Когда колдун Куан Чи убегал из Преисподней от Скорпиона, он обнаружил древнюю гроницу с мумиями армии Короля Дракона, бывшего первым императором Внешнего Мира. И он понял, что может использовать эту находку для того, чтобы стать непобедимым. А для этого нужны, ни многони мало, души погиших воинов, которыхнадлежить поместить в мумии. Чтобы претворить свой план в жизнь, Куан Чи заключает сделку с другим, не менее могущественным, колдуном Шанг Цунгу. Так появляется Смертельный Альянс. Но есть люди, которые способны помешать замыслу колдунов и им предстоит убрать эти помехи. Успешно убив тех, кто им мог помешал, колдуны возвращаются к процессу пробуждения мумий... В это время бог-покровитель Земли, Рэйден, собирает союз, состоящий из самых лучших бойцов. Его цель - остановить Смертельный Альянс.